西南大学是教育部直属重点综合大学，国家首批“双一流”建设高校，国务院批准的首批硕士、博士授予单位。依托于深厚的农业科技和教师教育底蕴，学校构建了一流学科、特色优势学科、基础学科、新兴交叉学科协调发展的学科格局，涵盖哲、经、法、教、文、史、理、工、农、医、管、艺、交叉学科等13个学科门类，建成30个一级学科博士学位授权点、5种专业博士学位，51个一级学科硕士学位授权点、35种专业硕士学位。生物学、教育学进入国家“双一流”建设学科行列，入选重庆市一流学科10个、重庆市重点学科42个，化学、农业科学进入ESI全球排名前1‰、18个学科进入前1%。

以支撑国家战略为发展重点，学校以农学和师范教育为传统优势推进学科升级迭代，用深化学科专业发展机制、改革优化学科调整机制和拔尖创新人才培养模式，实施以生物育种、智慧农业、智慧教育等为特色的“生物+学科群”“人工智能+学科群”建设，将学科逻辑转化为推动新质生产力发展的创新、人才和产业逻辑，建成资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室、西部（重庆）科学城种质创制大科学中心、中希文明互鉴中心、国家革命文物协同研究中心、国家教材建设重点研究基地等国家级科研平台，瞄准农业种源技术、种业科技振兴、粮食安全、乡村振兴、教育扶贫、师范教育协同提质计划、共建“一带一路”倡议、人类命运共同体建设等国家重大决策部署，进行关键技术攻关、科学研究和社会服务，在重大科技突破策源地、高端创新人才集聚地、创新人才培养主阵地建设中发挥学科引领作用，为建设特色鲜明的世界一流大学贡献学科力量。

以学科建设为牵引，西南大学立足时代需要，服务创新发展，大力实施研究生教育高质量发展行动计划，通过思政教育领航、一流导师队伍建设、精准招生人才选拔等“八大行动”，以及博士高质量发展“十大举措”，着力完善研究生思政教育、卓越培养、质量管理等三大体系，推动研究生教育质量全面提升，努力为党和国家事业发展培养造就大批德才兼备的高层次人才。

近三年，西南大学2名研究生获全国高校“百名研究生党员标兵”，2个研究生样板支部入选重庆市“样板支部”培育创建单位，1名研究生获全国2023年“最美大学生”，构筑起拔尖创新人才培养的高地。

2023年，学校入选重庆市卓越工程师学院试点建设单位，成功打造长安汽车、百度等头部企业订单式联合培养专业学位研究生项目；入选首批“国优计划”试点高校，承担本研衔接公费师范生培养任务；构建与中国农业科学院、国家教育行政学院等联合培养学术学位研究生模式，获批国际产学研用合作中外双导师联合培养研究生专项。